組織図

理事長（中込和幸）,監事,監査室長,理事会,企画戦略局長,コンプライアンス室長,運営会議,病院,訪問看護ステーション,神経研究所,精神保健研究所,トランスレーショナル・メディカルセンター,メディカル・ゲノムセンター,脳病態統合イメージングセンター,認知行動療法センター,事務部門

病院

病院　病院長,副院長,精神診療部,司法精神診療部,脳神経内科診療部,小児神経診療部,総合内科部,総合外科部,外来部,手術・中央材料部,放射線診療部,臨床心理部,臨床検査部,身体リハビリテーション部,精神リハビリテーション部,医療連携福祉部,薬剤部,看護部

神経研究所

神経研究所,研究所長（岩坪威）,疾病研究第一部,疾病研究第二部,疾病研究第三部,疾病研究第四部,疾病研究第五部,疾病研究第六部,疾病研究第七部,病態生化学研究部,微細構造研究部,代謝研究部,免疫研究部,神経薬理研究部,遺伝子疾患治療研究部,モデル動物開発研究部

精神保健研究所

精神保健研究所,研究所長（張賢徳）,ストレス・災害時こころの情報支援センター,公共精神健康医療研究部,薬物依存研究部,行動医学研究部,児童・予防精神医学研究部,精神薬理研究部,精神疾患病態研究部,睡眠・覚醒障害研究部,知的・発達障害研究部,地域・司法精神医療研究部

トランスレーショナル・メディカルセンター

トランスレーショナル・メディカルセンター,センター長（小牧宏文）,情報管理・解析部,臨床研究支援部

メディカル・ゲノムセンター

メディカル・ゲノムセンター,センター長（岩坪威）,臨床ゲノム解析部,ゲノム診療開発部,バイオリソース部

脳病態統合イメージングセンター

脳病態統合イメージングセンター,センター長（中込和幸）,先進脳画像研究部,臨床脳画像研究部

認知行動療法センター

認知行動療法センター,センター長（久我弘典）,認知行動療法診療部,研究開発部,研修指導部

訪問看護ステーション

訪問看護ステーション,施設長（吉田寿美子）

事務部門

事務部門,総務部,総務課,人事課,労務管理室,研究所事務室,企画経営部,企画経営課,企画医療研究課,情報管理室,財務経理部,財務経理課,医事室,図書館